این قرن 23 است. دریاسالار جیمز تی کرک مربی آکادمی استارفلت است و احساس پیری می کند. USS Enterprise - که اکنون یک کشتی آموزشی است - از حضور در کشتی خود در یک کروز مسافرتی دو هفته ای ، باعث می شود که او احساس جوانی نکند. اما سفر دریایی آموزش هنگامی که سالهای پس از سالها تبعید ظاهر می شود ، به یک مأموریت جدی کشنده تبدیل می شود که نامش خان نونین سینگ - فاتح بدنام از اواخر قرن بیستم کره زمین. خان بعداً فاش كرد كه سیاره Ceti Alpha VI منفجر شد و مدار سیاره پنجم را به عنوان پناهگاه شبیه مریخ تغییر داد. او شروع به ضبط Project Genesis ، یک وسیله مخفی برتر که قدرت خلقت خود را دارد و از بین بردن مطلق کرک را می کشد